Konečně jsem našel jeho řešení. Uložte soubor sh dostupný na adresehttps://gist.github.com/943776 a spusťte"./mysql2sqlite.sh DBNAME --databases DBNAME -u DB_USERNAME -pDB_PASSWORD | sqlite3 database.sqlite
"(bez qoutes as "`") v souboru php. Uložte oba soubory do jedné složky