To zní složitě. Nechápu, proč 32000 - mysql odmítá vytvořit více databází než to? Jaká chyba se zobrazí? Zdá se, že je to libovolné - možná je to konfigurační proměnná, kterou lze změnit?
Několik možností. Můžete spustit více než jeden mysql server , každý s jiným datovým adresářem. Nemyslím si, že by to pomohlo, ale můžete se podívat na úložiště NDB, zvládne to tabulkové prostory což vám může umožnit ukládat data na více místech.