Dostával jsem stejnou chybu a po prohledání prvních 4 stránek google a vyzkoušení všeho, co bylo navrženo (oprava tabulek, přesunutí souboru my.cnf, vymazání zámků, restartování atd.), nic nefungovalo. Ukázalo se, že to bylo proto, že jsem ručně vyčistil některé staré binární protokoly (binary.00001, binary.00002 atd.), ale neaktualizoval jsem soubor binary.index, aby odpovídal. Smazal jsem příslušné řádky z binary.index a prostě to fungovalo.