Hibernate ManyToMany vyberte

Tento problém je možné vyřešit dvojitým mapováním vašeho přidružení následujícím způsobem pomocí @Where anotace.

@ManyToMany(mappedBy = "agents") 
@Where(clause = "status = 'ACTIVE'")
private List activeMissions

@ManyToMany(mappedBy = "agents")
private List missions

Kompletní vysvětlení lze nalézt zde https://thoughts- on-java.org/hibernate-tips-filter-entities-mapped-association/