JPA generuje duplicitní klíče

Měli byste použít GenerationType.IDENTITY vygenerovat pdfid pomocí automatického přírůstku namísto GenerationType.AUTO pro FileDetail entity.

@Entity
public class FileDetail implements java.io.Serializable{
    @Id
    @GeneratedValue(strategy = GenerationType.IDENTITY)
    private Long pdfId;
}

GenerationType.IDENTITY