Určitě byste to mohli udělat přímo v podkladové databázi, pokud byste byli ochotni se tam ponořit (struktura je docela jednoduchá s tabulkami pojmenovanými podle odpovídajícího ID zdroje). Můžete z toho dokonce udělat své vlastní API pomocí rozšíření (ačkoli byste si měli dávat pozor na oprávnění).
Také by vás mohla zajímat nová podpora (master only atm) pro rozšíření DataStore API prostřednictvím pluginu v rozšíření – viz https://github.com/ckan/ckan/pull/1725