můžete vytvořit smyčku javascriptu, která tuto úlohu provede a poté ji spustit v mongoconsole.
var dbs = db.getMongo().getDBNames()
for(var i in dbs){
db = db.getMongo().getDB( dbs[i] );
print( "dropping db " + db.getName() );
db.dropDatabase();
}
uložte jej do dropall.js a poté spusťte:
mongo dropall.js