Pořadí vlastností dokumentu nemá vliv na indexování.
Můžete se o tom přesvědčit spuštěním tohoto dotazu:
db.people.find({LName: "abc"}).explain()
a pak tento dotaz:
db.people.find({LName: "jkl"}).explain()
měli byste vidět, že MongoDB použije index v obou případech (cursor vlastnost by měla být něco jako "BtreeCursor LName_1_FName_1" ).