Našel jsem problém.
V kódu:
Id bson.ObjectId `json:"id" bson:"_id,omitempty"`
mezi json: a bson: , použil jsem tab místo space takže problém nastává. Pokud změním tento řádek kódu na:
Id bson.ObjectId `json:"id" bson:"_id,omitempty"`
S jedním space mezi json: a bson: , ukázalo se, že to funguje dobře.