Použijte Python k načtení dat do Mysql

Ano, je to možné, budete muset načíst data z CSV souborů pomocí CSV modulu.

http://docs.python.org/library/csv.html

A vložit data pomocí vazby Python MySQL. Zde je dobrý úvodní návod:

http://zetcode.com/databases/mysqlpythontutorial/

Pokud již znáte python, bude to snadné