Váš aktuální dotaz v podstatě provádí INNER JOIN
kvůli consultant_id = 5
na stránce WHERE
doložka. Věřím, že skutečně chcete použít:
SELECT *
FROM consultant_memberships m
LEFT OUTER JOIN consultant_memberships_list l
ON m.`id` = l.membership_id
AND l.consultant_id = 5
WHERE l.membership_id IS NULL;