Narazil jsem na to minulou noc. Zjistil jsem, že FIND_IN_SET funguje zde:
SELECT * FROM table WHERE FIND_IN_SET(id, @parameter) != 0
...
intArray = new List<int>(){1,2,3,4};
conn.Command.Parameters.AddWithValue("parameter", string.Join(",", intArray));
Zjevně to má určitá omezení délky (našel jsem váš příspěvek, který hledá alternativní řešení), ale může vám to fungovat.