V podstatě pokud ponecháte pconnect=false v database.php pak se připojení na konci provádění každého skriptu automaticky uzavře a ve výchozím nastavení je nastaveno na false .
Pokud chcete, můžete použít
$this->db->close();
po každém provedení dotazu ukončete připojení ručně a použijte
$this->db->initialize();
před provedením jakéhokoli dotazu k opětovné inicializaci připojení po jeho uzavření.