Přišel jsem na odpověď na svou otázku. Jednalo se o problém s kompatibilitou s konektorem Mongo-Spark a verzí Spark, na kterou jsem upgradoval. Konkrétně hodnota findTightestCommonTypeOfTwo byla v PR přejmenována:
https://github.com/apache/spark/pull/16786/files
Pro Spark 2.2.0 je kompatibilní konektor Mongo-Spark také 2.2.0, takže v mém příkladu by se balíček načetl takto:
--packages org.mongodb.spark:mongo-spark-connector_2.11:2.2.0\
To by se mohlo v budoucnu změnit, takže při používání konektoru byste měli zkontrolovat kompatibilitu s používanou verzí Spark.